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纵观人类遗传学的前进历程，新方法和新技术的涌现及应用可谓层出不穷。尤其是二代测序技术成本的迅速下降，令很多在实验室中使用的方法和技术逐渐进行临床转化。越来越多的基因检测方案已经被成功地应用于临床疾病检测，比如Panel、WES、CNV-Seq和WGS等。

现阶段，很多临床大夫面临一个困惑，面对不同的产品，临床应用时究竟选择哪种产品更合适？为了更好的让临床医生和技术人员了解这些产品的各自优劣和偏向性，小编将遗传病检测中的Panel、WES、CNV-Seq和WGS做一简述，希望对您有所帮助。

panel

可以以某类系统疾病的辅助诊断为重点设计基因，一般包括数十（也可以单个基因或数个基因的超高深度测序）至数千个基因（如临床外显子组测序），如迈基诺心血管panel，一次检测一千多个基因，同时包括药物基因组学相关用药位点；

也可以以遗传筛查为重点设计基因，一般包括数个到数百个基因，如诺常安™优生优育二十一项基因检测，一次检测十九项单基因病+两项营养补充指导（VD+叶酸）。

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Panel检测适用情况

疾病特异性强，表型特异性较高，属于某一系统类疾病（如癫痫、周围神经病、遗传性听力损伤……），优先选择疾病panel。

Panel优势

1、小而精、聚焦性强、设计灵活：一个检测panel可以小至仅包含一个基因，也可以包含某一类疾病或某一系统疾病的所有相关基因；检测范围可以根据实际需要灵活掌握，如覆盖所有基因的外显子区域、或者已报道的位于非编码区的致病位点，甚至是基因全长。

2、测序深度深，更有利于低频突变的检出：考虑到测序成本，相同投入下，相较于WES或WGS，panel可以进行高深度测序。

3、较高的阳性检出率（这与临床送检策略有关），当临床表型较为典型或临床指向性较为明确时，panel的阳性率显著高于WES和WGS的检测。

Panel不足

1、临床表型指征性较差时，不适宜选择Panel检测

2、当患者有两种或两种以上核心表型的时候，往往是复杂遗传病的典型代表，增加了Panel错选的机会，所以复杂疾病不适宜选择Panel检测

全外显子组测序(WES)

全外显子组测序(WES)捕获所有外显子区域，约占整个基因组1-2％，将这些DNA序列进行高通量测序。

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以上文为例，对于神经系统疾病患者当遗传疾病表型被正确识别、确认时，WES可以辅助40%的患者得到确诊。

WES检测适用情况

疾病具有高度遗传异质性，表型特异性低，表型复杂，涉及多个系统，无法预料是否会出现新的表型，建议直接进行WES检测。

WES优势

1、人类疾病约85%的基因突变位于外显子区，WES技术可以很好地帮助研究者挖掘和探索新基因或致病基因

2、WES对于具有血缘关系或者具有严重症状的患者，以及具有多个症状的患者来说WES具有更高的诊断率

3、WES包含了＞85%的致病突变（包括非编码区突变），在各类数据库或文献中有更多的注释，便于临床医生的解读。

4、WES可以检测到编码区的VUS变异，用于人类基因组外显子研究非常重要

WES不足

1、目前已知的与人类疾病相关的致病突变有约10%是在非编码区，如果只检测外显子区，可能会遗漏这部分信息。

2、特殊基因组区域难以捕获（高GC含量、重复序列、假基因）

3、特殊变异类型难以识别（复杂拷贝数变异、结构异常）

迈基诺DiaWES™加强版全外，全面检测编码区和已报道的非编码区变异，利用BaitDesigner™智能化探针设计系统，更精准更全面的捕获特殊基因组区域，更准确的分析CNV和SV。

低深度全基因组测序（CNV-Seq）

CNV-Seq采用NGS技术对样本DNA进行低深度全基因组测序，将测序结果与人类参考基因组碱基序列进行比对，通过生物信息分析以发现受检样本存在的CNVs。CNV-Seq技术可应用于外周血、流产物以及产前样本分析，可作为一线产前诊断方法应用于临床，适用人群包括高龄孕妇、产前筛查高风险和超声异常胎儿等。

CNV-Seq优势

1、具有全基因组均匀覆盖的优点，可检测大于100Kb的CNV

2、高通量，一次上机可检测超过几十份标本

3、操作简单，配合自动化仪器，可以流程化操作

4、CNV-Seq平台兼容性好

CNV-Seq不足

1、无法检测异倍体，需补充STR检测

2、无法检测杂合性缺失

3、无法检测单基因病

全基因组测序(WGS）

全基因组测序(WGS）将整个基因组序列打断，无需进行基因捕获，直接建库上机测序。

WGS检测适用情况

其他测序方案阴性或者表型比较复杂或重症状态，WGS是可以考虑优先选择的方案，WGS为寻找外显子以外的区域，以及特殊变异形式（如密码子串联重复、染色体结构异常等）等致病变异具有重要价值。

WGS优势

1、WGS检测范围全面，不用捕获，对整个基因组进行检测。

2、WGS不仅可以检测编码区，还可以检测非编码区以及调控区。

3、可检出SV（含平衡易位、倒位）。

WGS不足

1、涉及高度重复或同源的基因组区域的检测及分析可能不准确。

2、找到新的变异对于临床医生而言，功能不确定需要进行验证，对临床医生解读造成一定的困难。

3、人类基因组参考序列仅来源于有限个体，部分基因组区域还存在参考序列的误差和空白间隙，变异识别可能出现假阳性和假阴性。

4、GC占比高区域的覆盖可能不完全。

5、深度低（30X），突变分析准确度低，容易导致大量假阳性突变，验证困难。

以上是小编对目前基因检测新方法的浅谈，希望可以帮助临床工作者在实际应用中能做出更好的判断。没有最好的检测，只有最合适的检测。

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